Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms