Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp48Q3V0C5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp48Q3V0C5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp48Q3V0C5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp48Q3V0C5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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