Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm29609Q3UU56 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm29609Q3UU56 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm29609Q3UU56 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm29609Q3UU56 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm29609Q3UU56 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm29609Q3UU56 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm29609Q3UU56 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm29609Q3UU56 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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