Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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SbsponQ3UPR9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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