Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc33Q3ULW6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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