Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Snx27Q3UHD6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Snx27Q3UHD6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx27Q3UHD6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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