Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trafd1Q3UDK1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms