Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Q3U6N9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Q3U6N9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q3U6N9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q3U6N9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms