Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U595 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U595 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q3U595 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U595 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U595 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U595 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U595 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U595 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U595 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U595 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q3U595 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U595 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U595 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U595 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U595 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q3U595 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms