Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ulk3Q3U3Q1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms