Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Kdm4dQ3U2K5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms