Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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