Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccdc69Q3TCJ8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms