Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rtl9Q32KG4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtl9Q32KG4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms