Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim71Q1PSW8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms