Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms