Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cnn2Q08093 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms