Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Prrx2Q06348 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms