Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Sox10Q04888 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sox10Q04888 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sox10Q04888 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sox10Q04888 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sox10Q04888 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sox10Q04888 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sox10Q04888 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sox10Q04888 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sox10Q04888 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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