Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Msx2Q03358 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms