Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb4Q02738 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms