Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col1a2Q01149 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms