Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama4P97927 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms