Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gfra1P97785 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gfra1P97785 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms