Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Bop1P97452 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Bop1P97452 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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