Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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