Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rad54lP70270 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms