Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UbdP63072 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UbdP63072 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UbdP63072 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UbdP63072 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UbdP63072 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UbdP63072 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UbdP63072 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UbdP63072 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbdP63072 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms