Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Olfr126-203ENSMUST00000217487 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rps28P62858 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rps28P62858 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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