Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2kP61087 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms