Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp25P57080 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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