Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Apobec1P51908 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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