Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TspoP50637 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TspoP50637 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TspoP50637 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms