Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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