Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nkx1-2P42580 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nkx1-2P42580 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms