Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PpardP35396 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PpardP35396 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PpardP35396 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpardP35396 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpardP35396 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpardP35396 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpardP35396 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpardP35396 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpardP35396 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpardP35396 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpardP35396 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpardP35396 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms