Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoc1P34928 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms