Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms