Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc1P29341 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc1P29341 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc1P29341 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc1P29341 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc1P29341 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc1P29341 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pabpc1P29341 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pabpc1P29341 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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