Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RxrgP28705 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms