Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NdnP25233 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NdnP25233 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NdnP25233 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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