Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tsta3P23591 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsta3P23591 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms