Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms