Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P20040 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P20040 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P20040 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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