Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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