Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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