Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DmdP11531 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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DmdP11531 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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DmdP11531 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DmdP11531 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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DmdP11531 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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DmdP11531 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DmdP11531 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DmdP11531 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
DmdP11531 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DmdP11531 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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