Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spta1P08032 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Spta1P08032 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Spta1P08032 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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