Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01790 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01790 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01790 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01790 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01790 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01790 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01790 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01790 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01790 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01790 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01790 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01790 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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