Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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